高風險慢性病患接種流感疫苗的禁忌症與一般人相同，如已知對「蛋」之蛋白質有嚴重過敏者，已知對疫苗的成份有過敏者；過去注射曾經發生嚴重不良反應者，均不予接種。另外，要特別注意當發燒或正患有急性中重疾病者，則應等病情穩定後再接種。
